目前，关于偏头痛与抑郁症共病的研究较多。大多数学者认为偏头痛和抑郁症之间的关系是双向的。前者会增加后者的风险，反之亦然。两者在病因、病理生理机制及临床表现上可能存在一定的相关性。正确认识这些联系可以改变未来的治疗策略，改善患者的预后。但二者关系的真实情况仍在讨论和研究中。偏头痛是导致抑郁还是抑郁导致偏头痛还不得而知。目前尚不清楚它们是否是病理途径的不同表现。偏头痛伴抑郁症的治疗具有挑战性。并不是所有的抗抑郁药都可以用来治疗偏头痛，也不是所有的偏头痛药物都可以用来治疗抑郁症。5-羟色胺再摄取抑制剂被广泛应用于抑郁症的治疗，但在预防偏头痛方面通常不是很有用。阿米替林可用于治疗偏头痛，但一般不用于治疗严重抑郁症。

        双相情感障碍是偏头痛患者的另情绪障碍，影响2-4%的人群。终生患病率为40%（女性44%，男性31%）。1型双相情感障碍的患病率接近1%，1型双相情感障碍的患病率在女性和男性中几乎相同。双相II的患病率从0.3%到5.0%不等，妇女有酗酒的危险。偏头痛和II型双相情感障碍的终生患病率为65%（75%为女性，40%为男性）。有报道称，有先兆偏头痛与双相情感障碍的相关性是无先兆偏头痛的三倍。双相II常被误诊为重度抑郁症，因此正确判断非常重要。在一项研究中，34.3%的偏头痛患者被诊断为精神障碍，其中4.9%被诊断为双相1型，7.8%被诊断为双相II型。。双相情感障碍患者抑郁的发生率比躁狂症高（接近3:1），并且几乎一半的时间都表现出躯体症状。在双相情感障碍的治疗中，抗抑郁药可能诱发躁狂或轻度躁狂发作，或增加循环频率，或促进快速循环发作，这使得治疗更加困难。因此，双相情感障碍患者应谨慎使用抗抑郁药物。